新竹地檢署指出，豐邑機構在建案審查通過後，應依規定在建案週邊打設33.8公尺的H型鋼擋土樁，但豐邑機構為了節省成本，將擋土樁縮短為18.5公尺，從中減少了新台幣1億5千多萬元的擋土費用。為了掩蓋事實，豐邑在H型鋼擋土樁中添加了27公尺的劣質混凝土地質改良樁（CCP），但最終CCP也被縮短為15.5公尺。此偷工減料行為最終導致天坑坍塌。
事發後，楊文科成立專案小組調查坍塌原因，並嚴審改善計畫，規定在完成改善前不得復工。然而，專案小組多次否決復工申請，但楊文科在未經專案小組審查的情況下，私下承諾豐邑建設可以繼續施工。
檢方強調，楊文科身為新竹縣長，本應善盡監督之責，但他卻一再接受建商請託，並對所屬公務員施壓，甚至與建商共同圖利，在未經專家確認現場安全的情況下非法復工。另外，新竹縣政府前工務處處長江良淵也包庇建商，與楊文科合謀復工，而建商亦因施壓專業技術人員，導致業務登載不實，違反建築法規。
經全面審酌，檢方請求法院對楊文科等人從重量刑，並沒收犯罪所得2億3,598萬8,812元，以儆效尤。同時，請求法院沒收江良淵的犯罪所得1,483萬5,000元。
